O mundo tem ciência da existência da Shadaloo mais ou menos na mesma época que o primeiro torneio termina, durante os anos de 1988 a 1992. A organização criminosa suprema rapidamente toma conta de todos os cartéis criminosos ao redor do mundo e espalha o terror através de seus tentáculos. Ao seu lado, alguns dos lutadores mais poderosos do mundo, incluindo o seu líder, Bison. Investindo pesado em persuasão e poderes psíquicos (obtidos de maneira desconhecida até hoje), Bison consegue influenciar politicamente o mundo e constrói bases bélicas e científicas da Shadaloo em diversos locais, para realizar seus intentos de dominação mundial.

Guerreiros são perseguidos para se juntarem à facção criminosa, incluindo ex-campeão mundial, Sagat, que acaba aceitando se aliar à Bison em troca de uma revanche contra Ryu. Entretanto, o próprio ditador tailandês tinha seus próprios planos para Ryu: o corpo de Bison não estava aguentando a crescente de seu Psycho Power e estava falecendo rapidamente. O corpo do jovem karateca era o “estepe” perfeito para o lutador psíquico. Além de Sagat, Bison une-se com o ninja espanhol Vega e com o ex-boxeador profissional Balrog, tornando-os seus generais e ampliando sua influência no circuito Street Fighter. Outros, como o punk Birdie, buscam a Shadaloo por vontade própria, visando lucrarem junto com a organização.

Bison precisava de um novo corpo e passou a investir pesado em engenharia genética com o projeto das Dolls, com sua divisão de armas, que mais tarde se chamaria SIN, e o projeto do seu Psycho Drive, que ampliava seus poderes psíquicos a níveis estratosféricos. No entanto, agentes autônomos passaram a persegui-lo e desejar sua morte, como a detetive da Interpol Chun Li, que desejava vingança pela morte de seu pai pelas mãos da Doll Killer Bee. Junto à ela estava o sensei Gen, mestre do pai de Chun Li que jurou protegê-la após a morte de seu discípulo, e os soldados Nash e Guile, que queriam levar Bison à justiça, após terem descoberto que ele havia corrompido as forças armadas americanas.

Também nesta época Sagat passa a ser perseguido por Dan Hibiki, filho de Go, lutador de Muay Thai que falecera após lutar com Sagat. Já Ryu passa a ser perseguido por Sakura, uma jovem prodígio que decidiu se tornar sua discípula custe o que custar, que por sua vez (!!) era perseguida por Karin Kanzuki, sua eterna rival e uma das pessoas mais ricas do mundo. O guerreiro Akuma, passa a ser perseguido por Ryu, que deseja respostas sobre o poder maligno que ambos parecem possuir em comum, o Satsui no Hadou.

Após uma investida certeira de Nash, Chun Li e Guile à base principal da Shadaloo, eles conseguem encurralar Bison e plantar seus explosivos, ficando a cargo de Nash segurar Bison enquanto seus amigos fogem e a base começa a explodir, o que significava se sacrificar no processo. Ao mesmo tempo, um Ryu controlado psiquicamente pelo Psycho Drive de Bison enfrenta seus próprios amigos Ken, Sakura e Dan, para somente ser parado por Sagat, que acaba salvando o dia.

Notando que a base estava ruindo, uma recém desperta Cammy usa de suas habilidades para salvar as Dolls da base transportando-as para fora da zona da explosão e salvando a si mesmo. No entanto, sem que eles saibam Bison já havia transferido sua alma para a mística Rose, que junto de Guy tinham ido ao encontro de Bison para tentar derrotá-lo e salvar o mundo. Ou seja, ele não havia sido derrotado por completo, embora a Shadaloo tivesse caído, mas a história estava longe de acabar…

Lutadores Famosos nessa era

Não houve um torneio mundial nesta saga, então os lutadores abaixo são os mais fortes que se tem notícia e substituem os Guerreiros Mundiais nesta época.

Ryu	Ken	Akuma	Birdie	Chun Li	Guile	Blanka
Karatê Shotokan	Karatê Shotokan	Karatê Shotokan	Luta-Livre	Wu Shu	Forças Especiais	Capoeira
Japão	EUA	Japão	Inglaterra	China	EUA	Brasil
T. Hawk	Dee Jay	Fei Long	Killer Bee	Dhalsim	Zangief	E. Honda
L.L.N.A	Kickboxe	Kung Fu	Forças Especiais	Kabaddi	Sanbo	Sumô
México	Jamaica	H.K.	Inglaterra	Índia	Rússia	Japão
Nash	M. Bison	Sagat	Vega	Balrog	Dolls	Eagle
Forças Especiais	Ler Drit	Thai Kickboxe	Ninjitsu Espanhol	Boxe	Vários	Bojutsu
EUA	Tailândia	Tailândia	Espanha	EUA	Vários	Inglaterra
Adon	Gen	Rose	Cody	Guy	Sakura	Dan
Thai Kickboxe	Kung Fu	Soul Power	Kickboxe	Ninjitsu	Karatê Shotokan	Karatê Shotokan
Tailândia	H.K.	Itália	EUA	Japão	Japão	H.K.
Karin	Maki	R. Mika	Sodom	Yun	Yang	Rolento
Kickboxe	Ninjitsu	Luta-Livre	Kenjutsu	Kung Fu	Kung Fu	Forças Especiais
Japão	Japão	Japão	Japão	H.K.	H.K.	Alemanha

Também é nessa época que acontecem aparições de Evil Ryu e a misteriosa Ingrid.