“Há milênios, numa batalha com um deus decadente conhecido como Shinnok, fui responsável pela morte de uma civilização inteira. Para livrar todos os reinos da ameaça de Shinnok, entrei numa guerra que deixou a Terra por séculos sob uma terrível escuridão e bani o deus decadente, que foi amargar seu exílio em um lugar chamado Netherealm (Reino do Nada). Agora, depois da derrota de Shao Kahn pelas mãos dos guerreiros da Terra, Shinnok conseguiu escapar dos confins de Netherealm. A guerra está para começar novamente e, só desta vez, pode ser vencida pelos mortais.”
– Raiden, deus do trovão e protetor da Terra

Com o fim do reinado de Shao Kahn, derrotado pelos guerreiros terrenos, a Terra e o OutWorld voltaram ao normal. OutWorld voltou a ser o planeta cheio de vida, conhecido como Edênia. Shao Kahn havia aberto um portal que uniu os dois mundos. Johnny Cage, morto durante a invasão do Exército do Imperador, finalmente conseguiu paz no céu. A guerra abalou as estruturas do clã Lin Kuei, que foi dissolvido mais tarde. Sindel recuperou sua consciência e ocupa o trono de Edênia por direito. Formou-se na Terra uma agência para investigar o OutWorld, liderada por Jax e Sonya. Esta estava em missão para capturar Jarek, o último sobrevivente da organização criminosa Black Dragon (Dragão Negro), a que Kano e, provavelmente Kabal, pertenceram.

Shinnok e seu exército preparavam-se para entrar em confronto com os deuses supremos outra vez. Os generais da tropa eram Reiko e Reptile – banido para o Netherrealm por ser responsável pelo
genocídio de várias raças. Quan Chi fez, então, uma proposta irrecusável a Scorpion: vida, em troca de sua participação na guerra celestial.

Tanya, filha do embaixador de Edênia em novos reinos, convidou refugiados de outros mundos para seu reino. Sindel recebeu bem os refugiados até descobrir que Shinnok estava entre eles com seu Exército das Trevas. Tanya, a traidora, havia aberto um portal para Netherealm. Quan Chi capturou Kitana, e Liu Kang prontamente seguiu para Edênia para salvá-la.

Quan Chi liderou o ataque do Exército das Trevas aos céus. Pensou-se que Reiko tivesse morrido, mas logo ele ressurgiu. Quando Raiden voltou para casa para comemorar a vitória sobre Shao Kahn, ele só achou os deuses sendo atacados. Agora ele é um dos únicos deuses da Terra.

Mas logo apareceu outro sobrevivente da batalha celestial: Fujin, deus do vento, que já foi um dos guardiões do amuleto sagrado. Liu Kang falhou em sua missão de salvar Kitana e voltou para casa, onde encontrou seu velho amigo e ex-membro da Sociedade Lótus Branco, Kai. Ele foi treinado pelos maiores mestres da Ásia. Olhando tudo dos céus, Johnny Cage pediu para ser ressuscitado e lutar pela Terra, no que foi prontamente atendido por Raiden. A tenente Sonya continuava sua perseguição a Jarek quando se deparou com uma batalha muito maior. Suas desavenças terminaram, por ora, para lutar contra as forças de Shinnok. Jax, que os acompanhava, entrou na briga.

O renegado Sub-Zero veste de novo o uniforme Lin Kuei, usado por seu irmão mais velho, o quinto Sub-Zero (conhecido como Sub-Zero Classic). Foi ele que derrotou Shinnok no Netherealm quando recuperou o amuleto sagrado e os segredos foram passados para o irmão mais novo. Segredos que contêm a chave para a destruição de Shinnok.

A guerra está para começar: de um lado, os defensores da Terra liderados por Raiden; do outro, o Exército das Trevas de Shinnok e Quan Chi. O destino da humanidade está em suas mãos. Não permita a vitória das forças da escuridão!

Kombatentes

No lado da Terra tivemos.

• Liu Kang, atrás de Kitana;
• Kai, aliado de Liu na Lótus Branca;
• Raiden, agora mortal defendendo a Terra;
• Fujin, irmão de Raiden e deus dos ventos;
• Johnny Cage, revivivo por Raiden;
• Jax e Sonya Blade, com sua agência especial caçando Jarek;
• Sub-Zero, Kuai Liang, irmão querendo se redimir;

E do outro lado:

• Shinnok, querendo dominar tudo;
• Quan Chi, feiticeiro e braço direito do Deus Caído;
• Tanya, princesa traidora;
• Reiko, general das tropas de Shinnok;
• Scorpion, espectro revivivo por Quan Chi;
• Reptile, novo servo de Shinnok;
• Jarek, último membro fugitivo do Black Dragon;

Sem um lado definido temos:

• Goro, que ressurgiu após dado como morto em MK1;
• Kitana, sequestrada por Quan Chi e fora de combate;
• Meat, experimento macabro de Quan Chi;

Agência de Investigação dos Assuntos do OutWorld

Esta agência de investigação foi criada por Sonya e Jax após a invasão de 1º de Abril de 1995, e o seu objetivo é ficar em vigília, encontrar portais dimensionais e impedir que outworlders venham
para a Terra em segredo. Suas missões no planeta são as mais diversas possíveis, desde roubar amuletos em templos a tentar assassinar kombatentes. A geração que surgiu é muito talentosa, não representada apenas por um homem como quando Kung Lao derrotou Shang Tsung há 500 anos, e isso promoveu uma guerra de
guerrilhas entre os mundos.

No início, Sonya e Jax apenas uniram forças com grandes lutadores de Nova Iorque, e depois do restante dos EUA. Quando a invasão já tinha sido controlada, e tudo era reconstruído, a ameaça do ressurgimento dos Batalhões de Extermínio fez com que fossem levados a sério, e lhes foi dada uma sede e armamentos, além de batalhões e agentes treinados.

Atualmente, várias nações seguiram o exemplo de Sonya e Jax, e há postos de observação autorizados em vários cantos do mundo, representando a Agência de Investigação dos Assuntos do OutWorld. Apesar de Sindel ter passado a governar com a queda de Kahn, e Edênia ter ressurgido, ainda é uma terra de ninguém em vários pontos, e centaurianos e shokans em guerra, tarkatans passando fome e feiticeiros sedentos por poder podem tentar ir para a Terra a qualquer momento.

Adaptação de Mortal Kombat para Street Fighter RPG feito por Eric Musashi da Shotokan RPG e expandida/ajustada (principalmente storylines) por Fernando Jr.